Biochimie - Étude de la voie de biosynthèse de la NAD+ et d'une voie dite de « récupération »

Extraits

[...] Étude de la voie de biosynthèse de la NAD+ et d'une voie dite de « récupération » Q1. Enzymo p.3, Métabo p.2 (voir schéma) NAD+ est la forme oxydée (perte d'un électron) du Nicotinamide adénine dinucléotide (NAD - dérivé de l'acide nicotinique). Il s'agit d'une co-enzyme nicotinique dans le couple NAD+/NADH (réduction en NDAH lors de la prise d'un électron). Elle intervient dans les réactions d'oxydo-réductions lors de la glycolyse, dans le cycle de Krebs et dans la chaîne respiratoire (par phosphorylation oxydative). [...]

[...] coli présentée est une souche en mesure de synthétiser du quinolinate, grâce à la voie de biosynthèse de la NAD+. Cependant, le quinolinate est utilisée par l'enzyme NadC (3ème réaction de la chaîne) afin de produire du nicotinate ribonucléotide. Il est alors nécessaire de bloquer l'enzyme NadC pour permettre l'extraction du quinolinate en milieu de chaîne réactionnelle. Concernant les conditions de culture, il faut privilégier un milieu riche en L-aspartate (substrat de départ de la branche et en dihydroxyacétone phosphate (substrat de départ de la branche pour obtenir une plus grande quantité de quinolinate. [...]

[...] Pour l'enzyme NadC, le quinolinate possède deux groupes carboxyles contre un seul groupe pour le nicotinate ribonucleotide. L'un des groupes carboxyles est transformés en CO2. Q4. Métabo p.3, p.10, p.11. Il y a 4 liaisons haute énergie consommées pour la synthèse d'une molécule de NAD?. La première est dans la réaction NadC (liaison pyrophosphate dans le phospho-ribose pyrophosphate et libération d'un PPi), la seconde dans la réaction NadD (car il y a un ATP utilisé) et les deux dernières sont dans la réaction NadE (car utilisation d'un ATP et libération d'un AMP et PPi). [...]

[...] Si les 2 brins sont comme ceci : Il s'agit d'un feuillet de 6 brins (si j'ai bien compté) antiparallèles. En semi-développé : Brin 1 (sens du brin - NH - - CO Brin 2 (sens du brin - NH - - CO Si les 2 brins sont comme ceci : Il s'agit d'un feuillet de 6 brins parallèles. En semi-développé, cela donne Brin 1 (sens du brin - NH - - CO Brin 2 (sens du brin - NH - - CO Q16. [...]

[...] 10,9 (coefficient directeur de la pente) et 6.8 (ordonnée à l'origine). Il faut faire attention aux conversions ici Calcul de Vmax 1/Vmax = 6,8 Donc Vmax = 1/6,8 = (env.) 0,147 mol/L/min Calcule de Km pente= Km/Vmax Donc Km=10,9 x Vmax= 10,9 x 0,147 =1,60 mol/L Calcul de Kcat : il faut faire attention que les unités soient correspondantes ici. Kcat=Vmax/[Enzyme] (à mon avis tu pourras t'arrêter là en examen, mais pour info) Pour [Enzyme] : _ Il est marqué avant la Q5 qui identifie l'enzyme NadB que sa masse molaire est 60kDa. [...]